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Cette étude étend la base de données AlphaFold à l'échelle du protéome en intégrant 1,8 million de complexes protéiques hautement fiables prédits à partir de 4 777 protéomes, offrant ainsi une ressource fondamentale pour explorer les interactions moléculaires et découvrir de nouvelles structures émergentes.
Cet article présente une méthode pratique et compatible avec les laboratoires de biologie pour synthétiser des tensioactifs fluorés à base de perfluoropolyéther par couplage carbodiimide direct, permettant ainsi aux laboratoires de biologie de préparer leurs propres surfactants fonctionnels pour des applications de microfluidique à gouttelettes sans dépendre de sources commerciales.
Les auteurs ont amélioré la méthode de synthèse simultanée de 21 ARNt à partir d'un seul modèle d'ADN en identifiant et en modifiant les groupes limitants, permettant ainsi d'atteindre une activité de traduction comparable à celle obtenue avec des ARNt préparés individuellement.
Les chercheurs ont développé des protocellules lipidiques capables d'un mouvement directionnel guidé par la lumière grâce à une polymérisation contrôlée de l'actine, démontrant ainsi qu'une combinaison de réseaux d'actine ramifiés et linéaires est essentielle pour générer des protrusions membranaires et une motilité autonome.
Cette étude révèle qu'une atténuation transitoire de la contractilité cellulaire reprogramme les cellules épithéliales en un état de type leader, piloté par des protrusions et une réorganisation des signaux mécaniques (ERK), ce qui fluidifie les tissus confluents en favorisant une migration collective cohérente.
Cette étude démontre que l'ingénierie des fibres de curli produites par *E. coli* Nissle 1917, notamment via la fusion avec l'antagoniste SSL3, permet de transformer ces amyloïdes naturellement inflammatoires en plateformes modulables capables d'inhiber efficacement l'activation du récepteur TLR2 et de supprimer les réponses immunitaires innées dans les cellules humaines.
Cette étude démontre que l'association de la manipulation liquide automatisée et de l'apprentissage actif permet d'optimiser efficacement la composition du système PURE pour améliorer le rendement de synthèse protéique, tout en révélant que les facteurs d'optimisation dépendent de la concentration en ADN et varient selon les gènes spécifiques.
Cette étude démontre qu'une stratégie de contrôle métabolique dynamique à deux étapes, combinant l'optimisation de l'expression des voies et la régulation du flux de NADPH, permet à une souche d'*E. coli* ingénierée de produire 140 g/L d'éthylène glycol à partir de xylose avec un rendement de 92 % en bioréacteur.
Cette étude présente une nouvelle approche de guide d'ARN conditionnel (intcgRNA) déclenché par un intron endogène, démontrant que cette méthode permet d'activer l'édition génique par CRISPR/Cas9 uniquement dans les cellules exprimant le gène cible, améliorant ainsi la spécificité et réduisant les effets hors cible lors d'applications in vivo.
Ce papier présente CombinGym, une plateforme de référence intégrant quatorze jeux de données de mutagénèse combinatoire et évaluant neuf algorithmes d'apprentissage automatique pour combler le fossé actuel dans la conception de variants protéiques combinatoires, tout en démontrant l'efficacité de l'apprentissage supervisé et de l'utilisation de données de mutations d'ordre inférieur pour prédire et optimiser expérimentalement les propriétés fonctionnelles des protéines.
Cette étude présente l'ingénierie systématique de promoteurs bactériens à deux entrées dans *Escherichia coli* utilisant des senseurs Marionette pour créer des interrupteurs logiques AND robustes, tout en établissant des règles de conception pratiques pour surmonter les défis de la fuite basale et des dépendances contextuelles.
Cette étude démontre que l'expression de transporteurs hétérologues améliore significativement l'activité de la phénylalanine ammonia-lyase chez *Lacticaseibacillus rhamnosus* GG en surmontant les limitations de transport du substrat, offrant ainsi une stratégie prometteuse pour le développement de biothérapies probiotiques contre la phénylcétonurie.
Ce manuscrit présente le Cadre Cepeda, une architecture préclinique modulaire et axée sur la sécurité, validée par 21 000 cycles de simulation, conçue pour tester l'hypothèse d'une rajeunissement partiel coordonné ciblant les 12 marqueurs officiels du vieillissement tout en minimisant les risques de reprogrammation incontrôlée grâce à un système de neuf mécanismes de protection.
Cette étude caractérise sept promoteurs inductibles pour *Zymomonas mobilis*, dont plusieurs sont décrits pour la première fois chez cette bactérie, et identifie les paires VanRAM-PvanCC et CinRAM-Pcin comme particulièrement prometteuses pour l'ingénierie métabolique.
Cette étude démontre qu'il est possible d'implémenter une règle d'apprentissage local génétiquement encodée dans des bactéries *Escherichia coli* modifiées, permettant l'entraînement physique de réseaux de neurones biologiques pour des applications de calcul adaptatif et de thérapies cellulaires.
Cette étude multi-laboratoires démontre que les coquilles de microcompartiments bactériens constituent une plateforme modulaire et robuste permettant l'encapsulation, la stabilisation et la coopération fonctionnelle de multiples enzymes via le système SpyCatcher-SpyTag pour des applications en ingénierie métabolique.
Cette étude présente une plateforme intégrée en *Cupriavidus necator* permettant la production personnalisée de nanoparticules de PHA fonctionnalisées via l'optimisation génétique, la co-culture durable et l'ancrage de protéines, ouvrant la voie à des applications innovantes en biotechnologie.
Cette étude démontre que les déterminants de l'efficacité de l'édition CRISPR-Cas9 sont fortement dépendants du contexte biologique et varient selon les espèces, ce qui remet en question l'existence d'un modèle universel tout en soulignant l'importance des données endogènes pour améliorer la conception des ARN guides.
Cet article a été retiré car les auteurs ont découvert que l'activité biologique des peptides isolés était en réalité due à une co-purification avec des antibiotiques utilisés lors du processus de production, et non à la microcine B17 elle-même.
Cet article présente une boîte à outils plasmidique standardisée et améliorée, comprenant des vecteurs clés et des systèmes de sélection optimisés, qui simplifie l'écriture génomique à grande échelle dans les cellules de mammifères en surmontant les limitations techniques de la méthode mSwAP-In.